MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocaldococcus vulcanius M7 chromosome

Total Repeats: 48965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013407	TTAA	2	8	66	73	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013407	TTAA	2	8	132	139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013407	TTAT	2	8	178	185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013407	ATTAA	2	10	200	209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013407	ATC	2	6	305	310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013407	T	6	6	395	400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013407	TTTAAG	2	12	447	458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013407	TTA	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013407	CTG	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013407	TAA	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013407	AT	3	6	638	643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013407	ATT	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013407	T	6	6	670	675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013407	AATA	2	8	689	696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013407	TA	3	6	695	700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013407	TAC	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013407	TCA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013407	TATG	2	8	746	753	25 %	50 %	25 %	0 %	261402132
19	NC_013407	TTA	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402132
20	NC_013407	ATG	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402132
21	NC_013407	ATT	2	6	900	905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402132
22	NC_013407	AG	3	6	963	968	50 %	0 %	50 %	0 %	261402132
23	NC_013407	TGA	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402132
24	NC_013407	TAT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402132
25	NC_013407	TAAAA	2	10	1028	1037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013407	ATT	2	6	1041	1046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
27	NC_013407	TCT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402133
28	NC_013407	TCT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402133
29	NC_013407	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	261402133
30	NC_013407	TC	3	6	1179	1184	0 %	50 %	0 %	50 %	261402133
31	NC_013407	CTC	2	6	1243	1248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402133
32	NC_013407	CCT	2	6	1354	1359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402133
33	NC_013407	TAAC	2	8	1379	1386	50 %	25 %	0 %	25 %	261402133
34	NC_013407	TAT	2	6	1404	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
35	NC_013407	TTA	2	6	1419	1424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
36	NC_013407	TTA	2	6	1455	1460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
37	NC_013407	CATT	2	8	1464	1471	25 %	50 %	0 %	25 %	261402133
38	NC_013407	T	6	6	1475	1480	0 %	100 %	0 %	0 %	261402133
39	NC_013407	ATT	2	6	1502	1507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402133
40	NC_013407	TTATT	2	10	1587	1596	20 %	80 %	0 %	0 %	261402133
41	NC_013407	GTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402133
42	NC_013407	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
43	NC_013407	T	6	6	1670	1675	0 %	100 %	0 %	0 %	261402133
44	NC_013407	TCC	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402133
45	NC_013407	ACAA	2	8	1688	1695	75 %	0 %	0 %	25 %	261402133
46	NC_013407	TCTTAT	2	12	1713	1724	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	261402133
47	NC_013407	AAT	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
48	NC_013407	ACT	2	6	1748	1753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402133
49	NC_013407	CAT	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402133
50	NC_013407	AAT	2	6	1848	1853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
51	NC_013407	AT	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	261402133
52	NC_013407	TTTTC	2	10	1958	1967	0 %	80 %	0 %	20 %	261402133
53	NC_013407	ATA	2	6	1986	1991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402133
54	NC_013407	T	6	6	2002	2007	0 %	100 %	0 %	0 %	261402133
55	NC_013407	TAAA	2	8	2024	2031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013407	ATA	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013407	TATAT	2	10	2116	2125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013407	TAAA	2	8	2260	2267	75 %	25 %	0 %	0 %	261402134
59	NC_013407	ATA	2	6	2277	2282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402134
60	NC_013407	TCT	2	6	2374	2379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402134
61	NC_013407	CTTT	2	8	2386	2393	0 %	75 %	0 %	25 %	261402134
62	NC_013407	TTGCTT	2	12	2438	2449	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	261402134
63	NC_013407	ATA	2	6	2469	2474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402134
64	NC_013407	CT	3	6	2522	2527	0 %	50 %	0 %	50 %	261402134
65	NC_013407	AAT	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402134
66	NC_013407	AATC	2	8	2567	2574	50 %	25 %	0 %	25 %	261402134
67	NC_013407	TTTC	2	8	2594	2601	0 %	75 %	0 %	25 %	261402134
68	NC_013407	T	6	6	2618	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	261402134
69	NC_013407	CAA	2	6	2645	2650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402134
70	NC_013407	CT	3	6	2656	2661	0 %	50 %	0 %	50 %	261402134
71	NC_013407	CATA	2	8	2707	2714	50 %	25 %	0 %	25 %	261402134
72	NC_013407	TTC	2	6	2763	2768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402134
73	NC_013407	A	6	6	2789	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013407	TCA	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402135
75	NC_013407	T	6	6	2861	2866	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
76	NC_013407	AG	3	6	2913	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	261402135
77	NC_013407	TCC	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	261402135
78	NC_013407	AAC	2	6	3088	3093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402135
79	NC_013407	TC	3	6	3098	3103	0 %	50 %	0 %	50 %	261402135
80	NC_013407	TAA	3	9	3120	3128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
81	NC_013407	TTA	2	6	3143	3148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402135
82	NC_013407	CAA	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	261402135
83	NC_013407	CCA	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	261402135
84	NC_013407	TTC	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
85	NC_013407	TCA	2	6	3305	3310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402135
86	NC_013407	TTC	2	6	3316	3321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
87	NC_013407	TCT	2	6	3329	3334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
88	NC_013407	T	6	6	3348	3353	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
89	NC_013407	AAT	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
90	NC_013407	TC	3	6	3392	3397	0 %	50 %	0 %	50 %	261402135
91	NC_013407	TTTTC	2	10	3410	3419	0 %	80 %	0 %	20 %	261402135
92	NC_013407	T	6	6	3433	3438	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
93	NC_013407	TTC	2	6	3445	3450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
94	NC_013407	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
95	NC_013407	T	6	6	3574	3579	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
96	NC_013407	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402135
97	NC_013407	TGT	2	6	3760	3765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402135
98	NC_013407	TAT	2	6	3766	3771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402135
99	NC_013407	TTG	2	6	3803	3808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402135
100	NC_013407	TCT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
101	NC_013407	AAT	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
102	NC_013407	AT	3	6	3875	3880	50 %	50 %	0 %	0 %	261402135
103	NC_013407	TC	3	6	3896	3901	0 %	50 %	0 %	50 %	261402135
104	NC_013407	AAT	2	6	3913	3918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
105	NC_013407	TCT	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
106	NC_013407	TCAA	2	8	3989	3996	50 %	25 %	0 %	25 %	261402135
107	NC_013407	CTTC	2	8	4070	4077	0 %	50 %	0 %	50 %	261402135
108	NC_013407	TCT	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
109	NC_013407	A	6	6	4165	4170	100 %	0 %	0 %	0 %	261402135
110	NC_013407	TCA	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402135
111	NC_013407	AAG	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	261402135
112	NC_013407	T	6	6	4334	4339	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
113	NC_013407	T	6	6	4409	4414	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
114	NC_013407	CTTT	2	8	4439	4446	0 %	75 %	0 %	25 %	261402135
115	NC_013407	T	6	6	4451	4456	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
116	NC_013407	T	6	6	4509	4514	0 %	100 %	0 %	0 %	261402135
117	NC_013407	TCT	2	6	4520	4525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402135
118	NC_013407	TTG	2	6	4536	4541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402135
119	NC_013407	ATAGG	2	10	4593	4602	40 %	20 %	40 %	0 %	261402135
120	NC_013407	AATAA	2	10	4645	4654	80 %	20 %	0 %	0 %	261402135
121	NC_013407	TAA	2	6	4725	4730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402135
122	NC_013407	A	9	9	4798	4806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013407	TTAG	2	8	4810	4817	25 %	50 %	25 %	0 %	261402136
124	NC_013407	AAT	2	6	4858	4863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402136
125	NC_013407	TCT	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402136
126	NC_013407	ATA	2	6	4986	4991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402136
127	NC_013407	CCTT	2	8	5084	5091	0 %	50 %	0 %	50 %	261402136
128	NC_013407	AAT	2	6	5109	5114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402136
129	NC_013407	TCT	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402136
130	NC_013407	T	6	6	5205	5210	0 %	100 %	0 %	0 %	261402136
131	NC_013407	CAAA	2	8	5237	5244	75 %	0 %	0 %	25 %	261402136
132	NC_013407	TC	3	6	5300	5305	0 %	50 %	0 %	50 %	261402136
133	NC_013407	CCCT	2	8	5377	5384	0 %	25 %	0 %	75 %	261402136
134	NC_013407	TAT	2	6	5391	5396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	261402136
135	NC_013407	GA	4	8	5409	5416	50 %	0 %	50 %	0 %	261402136
136	NC_013407	TCT	2	6	5457	5462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
137	NC_013407	AAT	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	261402137
138	NC_013407	T	6	6	5468	5473	0 %	100 %	0 %	0 %	261402137
139	NC_013407	TCT	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
140	NC_013407	T	6	6	5486	5491	0 %	100 %	0 %	0 %	261402137
141	NC_013407	GAT	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402137
142	NC_013407	TTC	2	6	5561	5566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
143	NC_013407	TCA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402137
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145	NC_013407	CTT	2	6	5686	5691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
146	NC_013407	TGG	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	261402137
147	NC_013407	TGCTAT	2	12	5747	5758	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	261402137
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149	NC_013407	TTG	2	6	5809	5814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402137
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151	NC_013407	CTT	3	9	5941	5949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
152	NC_013407	CTT	2	6	5965	5970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402137
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159	NC_013407	ATTA	2	8	6296	6303	50 %	50 %	0 %	0 %	261402137
160	NC_013407	TTG	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	261402137
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163	NC_013407	TCA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402137
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165	NC_013407	AACT	2	8	6467	6474	50 %	25 %	0 %	25 %	261402137
166	NC_013407	TTTGC	2	10	6478	6487	0 %	60 %	20 %	20 %	261402137
167	NC_013407	TCA	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_013407	TCT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	261402138
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170	NC_013407	T	6	6	6540	6545	0 %	100 %	0 %	0 %	261402138
171	NC_013407	CAT	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
172	NC_013407	T	7	7	6601	6607	0 %	100 %	0 %	0 %	261402138
173	NC_013407	TCA	2	6	6644	6649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	261402138
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176	NC_013407	TGGATA	2	12	6691	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	261402138
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185	NC_013407	T	6	6	7126	7131	0 %	100 %	0 %	0 %	261402138
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